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这个学霸过于自律 第430节

  眼中浮现出,从徐铭这里学到新东西的欣喜。

  会议进行到这里,相关流程和方案,基本算是初步确定下来。

  对此徐铭和周启深也没过多耽搁时间,随即宣布散会后便立刻开始投入实验。

  只等化学所根据这些数学约束条件,创造出物理世界中的对应物。

  ……

  之后两周时间里,化学所的蛋白质设计实验室,变成了一个数据与灵感交织的战场。

  数台高性能工作站日夜运行,使用蛋白质设计软件进行反向工程,将多尺度动态计算模型的约束条件,转化为氨基酸序列。

  “第135号设计,骨架拓扑满足要求,但分子动力学模拟显示,在第58位谷氨酸处会形成一个意外的盐桥,干扰静电梯度。”

  “更换它,同时检查β转角是否还能维持。”

  类似的对话在实验室每个角落发生,设计过程就像一个多维拼图,改动一个氨基酸,就可能会影响二级结构稳定性和表面亲水性,以及金属配位几何底物通道宽度。

  所有变量都相互耦合。

  当然在所有人的共同努力下,成果也是斐然,累计设计最终超过了两千个。

  6月19日,周三。

  本月话题热度最高的高考,已然彻底结束,无数考生终于能享受难得的惬意。

  整个人彻底放松下来。

  安心等待几天后,考试分数出炉。

  不过当视线转到化学所,蛋白质设计实验室内,纵使到了后半夜,依旧能看到很多忙碌的身影。

  周启深从家中来到实验室,还没走进去,便刚好在门口碰到了自己学生路川。

  那明显的黑眼圈,和打着哈欠的样子,显然这几天没少在实验室熬夜。

  “怎么还没有回去休息,这都多晚了?”

  见此周启深率先开口关心。

  虽说酶催化项目,如今关系到多个方面,有着不得不将其彻底攻克的理由。

  但毕竟身体是革命的本钱,必须要有所重视。

  听到熟悉的声音,路川下意识抬起视线,看到视野中的身影眼睛顿时放大几分。

  脱口询问道:“老师,你怎么现在过来了?”

  “翻来覆去睡不着,索性来实验室看看。”周启深接过话茬跟在后面解释。

  他身为化学所院士,酶催化项目的代表人,又是主动与国际数学挑战研究院建立的合作,尽管对徐铭抱有着百分之一百的信任,可身上涌现的压力却无法避免。

  在没有正式看到结果出炉前,想舒舒服服的睡觉只怕不太可能。

  周启深又询问道:“徐院还在里面吗?”

  “嗯。”

  路川点了点头,可能是想到了什么,嘴角浮现出一抹哭笑不得的尴尬。

  第二次同徐铭一起研发项目,让他对徐铭的超绝自律又有了新理解。

  除比在场每一个人更加能熬外,关键精神还很少。

  加上超强的天赋和效率,无形中也给其他人带来了不少压迫感。

  毕竟连堂堂的国家柱石天才,都还在努力工作,别人哪里好意思去休息。

  也只有像周启深这样上年纪的科研人员,才不得不回家及时补充精神。

  显然周启深对这种情况,早已是见怪不怪。

  抬手在对方肩膀上轻拍了下,然后转身推开实验室的房门朝里面走去。

  人群中他很快锁定徐铭,近前后主动搭话。

  “现在我总算是知道,你哪来那么多时间,能去研究几门学科知识。”

  “光眼下这份状态,简直比高中生还强。”

  “我看全世界都找不出第二个。”

  徐铭注意到来人,暂时停下手上动作,嘴角挂着淡淡笑容接过话茬。

  “可能是我经常锻炼的缘故吧。”

  “精神比较好。”

  “另外我也想早点,把酶催化项目结题,实现工业革命的重塑。”

  在深度睡眠等各项能力加持下,让他相比较其他人有更多的学习时间,且把自律当成了一种正向反馈。

  所以加班到这个时候,完全再正常不过。

  至于其他人,也就只能在心里崇拜。

  把徐铭的话悉数听进耳中,周启深不由心中一动,下意识试探性询问了句。

  “关于蛋白质结构的初步设计,进行的怎么办了?”

  “截止今天晚上,我们已经积累了两千个初步设计,且目前和超算中心方面取得了联系,从明天开始就会正式开展第一轮筛选。”

  徐铭沉声讲述道:

  “借助超级计算机的算力,能省去大量时间。”

  在这高达两千个初步设计方案中,其中绝大部分都无法得到想要的蛋白质结构。

  如果单靠人力进行实验来试错,那么无论科研经费还是研发周期,都会出现一个恐怖的数倍增长。

  但借助超级计算机和多尺度动态计算模型,则可以快速筛选掉一大部分设计。

  然后再通过他对结果洞察,确定最符合学术条件的方案去具体实验,若一切过程顺利的话,那么用不了多长时间就能得到理想蛋白质结构。

  成功合成需要的人工酶。

  感受着徐铭语气中散发出的自信和胸有成竹,周启深也不由得松了口气。

  身上自己给自己的压力,顿时减轻许多。

  “看来今晚我是来对了,真让人期待啊!”周启深脸上堆出灿烂笑容。

  翌日。

  徐铭同全体议题组员,接入超算中心会议室,把初步设计方案序列,输入到模型的快速评估模块。

  “序列正在输入。”

  “筛选标准为,折叠自由能低于-8.0千卡每摩尔,金属簇结合能预测值低于-12.0,底物结合通道在分子模拟中至少保持开放10纳秒。”

  “计算开始。”

  房间内两地同步播报声音响起,两千个设计被转化为数学模型。

  在数字宇宙中经历严酷的演化压力。

  有些序列理论上根本无法折叠;有些能折叠,但形成的口袋形状偏离要求;有些虽能结合金属簇,但静电梯度完全错误。

  伴随着一个个设计被筛选出局,留下可行性最高的极少部分方案。

  整个快速筛选共持续了十二个小时。

  众人一直待到了晚上九点,终于拿到筛选结果。

  “徐院。”

  “根据报告显示,在所有设计中,有13个在100纳秒模拟中保持了结构完整性。”

  “金属簇稳定结合,底物通道保持开放。”

  路川强忍着心中剧烈的情绪波动,当着全体组员的面向徐铭汇报,关于超级计算机对设计的筛选结果。

  在这13个通过筛选的设计中,很有可能就存在,实现酶催化所需的全新蛋白质结构。

  关键仅用了半个多月时间,就走到了这一步,放到以前他参与项目时,可以说连想都不敢想。

  偏偏徐铭将其变成了现实。

  当然他非常清楚,之所以能快速筛选,要归功于徐铭除数学和化学之外的信息算法水平,否则换成别人想把这些设计从两千筛选到十几个,花费几年时间在数学界都是件很正常不过的事情。

  甚至最终还得不到一个好的结果。

  对于这份报告,周启深同样喜不胜收,下秒接过报告激动的搭话。

  “可以开始合成了。”

  “十三个序列,依次做密码子优化,合成基因,构建表达载体。”

  然就在他话音落下的同时,却见位于主座的徐铭摇了摇头提出不同意见。

  “还是太慢了,要做二轮筛选。”

  “二轮筛选?”周启深眼神中流露出惊讶。

  在他看来只是对十三个设计合成,所需花费的时间和实验次数是能够接受的,只要其中有一个设计,能通过最终的催化反应实验,那么便代表这项现代化学绝症,被彻底解决治疗好。

  结果徐铭则表示,还要在十三个设计基础上,再次进行新一轮筛选。

  徐铭口中的第二轮筛选,自然是由他来执行。

  最好通过结果洞察,确认可行性最高的那个,直接省掉后面的合成。

  念头停留在这里,徐铭也没卖关子,直接用轻描淡写的语气进行回答。

  “我会亲自动手展开二轮筛选,给我几天时间。”

  “那好吧。”周启深想了想果断答应下来。

  反正酶催化的研究,进展到这里,已然能称得上是无比高效。

  多等上几天并无影响。

  不过他也没指望,仅一次就可以成功,默默在心里做出了依旧全部进行合成实验的决定。

  徐铭并未去研究其他人的想法,拿到那13个设计后便开始分析起来。

  而结果正如他想的那样,花费几天时间后,他顺利确认了一个可行性最高的设计。

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